四川农业大学以区域社会经济发展和农业现代化需求为导向，以“产、学、研、用”结合为基础，多举措推动科技创新和成果转化。  

建设创新团队。结合“协同创新中心”建设，全面实行“以项目任务为载体、流动不调动”的人员聘任模式和“来去自由、内外结合”的合作模式，组建 20 多个“学术大师 + 创新团队”形式的协同创新团队。在完善各项人才政策的同时，实施以创新人才与团队建设为核心的系列专项支持计划，建成部省级创新团队 22 个，形成融合型校级创新团队 57 个。设立科技成果转化基金，将开展成果转化工作量纳入年度考核范围，并大幅增加成果转让收入中对科技人员的奖励比例，充分调动广大教师积极性。

搭建创新平台。每年投入1500万元用于科研平台建设，建成国家科技基础条件平台1个、省部级研究院（所、中心）和实验室 22 个。合作共建杂交水稻国家重点实验室西南研究基地、水稻和玉米遗传育种四川省国际科技合作基地、国家茶检中心（四川）川农大研发中心。牵头共建省级协同创新中心 3 个，参与共建培育国家级协同创新中心 1 个。将位于雅安市的“教学科研园区”、崇州市的“现代农业研发基地”、海南省的“水稻育种南方基地”和云南省的“玉米育种南方基地”打造为农业科技集中研发基地。

促进成果转化。与全省 60 多个市、州、县（ 区） 签订科技合作协议，共建种子生产、林木开发等试验示范基地 200 余个。通过与地方共建试验示范基地和科技园区、同企业共建院士和博士工作站、建设农业科技专家大院、成立产业技术创新联盟等，逐步形成多主体、多层次、多途径配合的科研合作模式。建立技术转移机构，搭建成果转化平台，2014 年学校新农村发展研究院成为国家技术转移示范机构。